为了做到层次分明、脉络清晰，常常将正文部分分成几个大的段落。这些段落即所谓逻辑段，一个逻辑段可包含几个小逻辑段，一个小逻辑段可包含一个或几个自然段，使正文形成若干层次。论文的层次不宜过多，一般 不超过五级。
为了反映文章的猫石对话科学依据、作者尊重他人研究的严肃态度以及向读者提供有关信息的出处，正文之后一般应列出参考文献表。
切忌超长段落。一般一个段落以3到5个句子为宜，千万不要追求一气呵成的感觉而堆在一起，动辄一页纸的大段落让谁看了都犯愁。一定要让文章看起来简洁清爽。
根据上述所出现的语言、用语问题及医学生现阶段英语SCI 论文写作的现状, 在论文写作之前, 先充分相关的英文文献, 关了解相应的英语写作方式与方法, 掌握相关的专业用语, 培养英文思维习惯。在写作的过程中, 首先要正确的使用书面语, 避免使用口头语;其次要恰当的使用连词及连接词, 以确保整个语篇的衔接并突出行文的重点;同时要注意用语及时态的选择, 使之在细节上能够准确传达作者的意图。
非母语写作本身就很有挑战性, 只要医学生在准备学术写作时多多阅读英语文献, 掌握上述的语言技巧并应用到具体的论文写作实践中, 就能在很大的层面上其学术论文不在语言的层面上被拒。
SCI论文标题要创新、简洁。创新是因为写科技文章的目的在于报道新的科技进展，缺乏创新因素就会失去发表的意义。但运用创新要建立在已有的科研基础上，太过于“创”这个字可能会适得其反。
文先于题,在已有科技的基础上,先写成论文,然后再根据论文的主笔来拟定标题。或先定标题,作论文,并可设想几个不同的标题,再根据论文的内容相互比较,择其中贴切、醒目者用之。一般说来,前者常用于写作回顾性分析、临床总结、病例报告等类论文,后者常用于写作前瞻性研究、调查报告、综述等类论文。
标题一般不应是陈述句，因为标题主要起标示作用，而陈述句容易使标题具有判断式的语义;况且陈述句不够精练和醒目，重点也不易突出。少数情况(评述性、综述性和驳斥性)下可以用疑问句做标题，因为疑问句可有探讨性语气，易引起读者兴趣。例如：Can Agricultural Mechanization be Realized Without Petroleum?(农业机械化能离开石油吗?)。
英文题名以短语为主要形式，尤以名词短语常见，即题名基本上由一个或几个名词加上其前置和（或）后置定语构成；短语型题名要确定好中心词，再进行前后修饰。各个词的顺序很重要，词序不当，会导致表达不准。
应标注与中文关键词对应的英文关键词。编排上中文在前，外文在后。中文关键词前以“关键词：”或“[关键词]”作为标识；英文关键词前以“Key words：”作为标识。
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